[VIP第1年] 指数:3
02FGFR通路的异常调控FGF/FGFR通路的异常调控由多种因素介导，包括：基因改变（扩增、突变和染色体易位）；自分泌和旁分泌信号；血管生成以及上皮间质转化（EMT），进而促进细胞增殖、上皮间质转化和血管生成，并推动**的发***展、侵袭、转移等（图2），其中主要的三种调控途径为：a.FGFR基因扩增导致的蛋白过表达；b.***性突变,该突变通常会导致配体亲和力的提高或受体二聚化的增加及活化（配体不存在的情况下），吉林全平台迈杰转化医学NGS平台经验丰富，或激酶结构域的组成性***；c.由染色体易位导致的基因融合。图2FGFR异常调控的致*机制[5]图2FGFR异常调控的致*机制[5]03FGFR异常形式以及在不同**中的分布FGFR常见变异形式包括基因扩增/过表达、***突变、基因融合等，此外还有重排，吉林全平台迈杰转化医学NGS平台经验丰富、激酶结构域重复及自分泌***等。FGFR的异常表达已在多种实体瘤肿中检测到，如过表达常发生在肺*、脑*，吉林全平台迈杰转化医学NGS平台经验丰富、头颈*、前列腺*等，融合常发生在骨髓增生综合征、T细胞淋巴瘤、膀胱*和肝内胆管*等（表1）。迈杰转化医学具体包括全套的Leica组织样本制备系统，Ventana、Leica、DAKO等全自动免疫组化仪。吉林全平台迈杰转化医学NGS平台经验丰富
thermofisherscientific)等。研究发现，基于pcr-ce分型时，相同片段长度的等位基因中存在重复区域序列结构不一致的情况。二代测序技术(secondgenerationsequencing，sgs)又称为下一代测序技术(nextgenerationsequencing，ngs)，具有测序通量高、速度快的优点。ngs不仅能从长度多态性上对str基因座进行分析，还能从序列上发掘str基因座的遗传多态性。随着ngs测序成本越来越低、测序读长逐渐的增加，ngs对str分型技术也越来越成熟。近年来，ngs技术已经应用于法医学str分型研究。相比于pcr-ce分型，ngs技术在y-str基因座的分析中具有很多优势：1、样本输入量低，使得微量样本及降解样本检材的分型研究变为可能；2、准确性高，能够全部覆盖基因座的每个碱基并通过产出高测序深度保证y-str基因座各等位基因的高概率精确判断的严谨性；3、能够获得y-str等位基因间的核苷酸差异信息，由于**重复结构存在差异或扩增区段内存在变异(侧翼序列的碱基突变或插入缺失)，序列长度相等的等位基因可能是具有遗传稳定性的完全不同的等位基因，这种y-str序列多态性是个体识别分析的宝贵资源；4、成本低，通过对每个样本检材添加标签一次可以同时对多个样本进行平行测序。 吉林多靶点迈杰转化医学NGS平台服务至上迈杰转化医学围绕生物标志物研究、伴随诊断开发，建立了完善的核酸组学、蛋白组学、细胞组学技术平台。
二、一代测序简介1、发生和发展***代测序技术是Sanger于20世纪70年代中末期发明的双脱氧链终止测序法，手动测序，用同位素标记，Sanger也因此获得其第2个诺贝尔奖（在Sanger发明双脱氧链终止测序法前WalterGilbert发明化学降解法测定DNA序列）；80年代出现***台自动化测序设备，荧光标记代替同位素，计算机图像识别；90年代中期测序仪重大改进，毛细管电泳替代凝胶电泳；2003年完成人类基因组测序工作。2、基本原理以单条DNA链为模板合成互补链，在DNA复制过程中，合成原料（2’脱氧核苷酸dNTP）中掺入标记过的2’3’ddNTP（双脱氧链终止测序法由此而来），就会产生一系列末端终止的DNA链，并能通过电泳按长度分辨。不同末端终止DNA链的长度是由掺入到新合成链上随机位置的ddNTP决定的。经PCR扩增反应，可以得到一系列长度不同的产物，由于ddNTP带有荧光标记，对产物进行电泳分离，并用相应的仪器进行检测，就可以读出模板的序列。链终止法反应的**仍是PCR法。作者：心平气和链接：源：知乎著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。
既节约时间又降低测序成本。目前，基于法庭科学领域运用**多的ngs系统为illumina公司的miseqfgxtm系统和thermofisher公司的iontorrentpgmtm系统，但针对以上平台的二代测序商业化str分型试剂盒的研发尚处于起步阶段，主要有powerseqautosystem(promega，madison，wi,usa)、forenseqtmdnasignatureprepkit(illumina，sandiego，ca，usa)和precisionidglobalfilerngsstrkit(termofisher，waltham，ma，usa)。但以上试剂盒涉及的y-str相对较少，三个试剂盒分别包含了1个y-str基因座、26个y-str基因座、2个y-str基因座。同时存在试剂盒价格昂贵，配套的数据分析软件只能针对各自开发试剂盒，参数的设置相对固定，只能对固有基因座的测序数据进行分析，不利于法医学实际应用。因此，构建一种适用于当前主流二代测序检测平台miseqfgxtm系统及开放性测序数据分析软件straitrazor、myflq等，且能容纳更多y-str基因座的复合扩增体系具有一定的意义。技术实现要素：本发明的目的是制备检测更多y-str基因座的试剂盒，提高了父系亲缘关系分析能力和鉴定效能。本发明首先保护引物组合，可包括引物1—引物120；引物1—引物120均为单链dna分子，核苷酸序列依次可如seqid**—seqid**20所示。迈杰转化医学严格按照IS013485标准规定建立质量体系。
包括67个y-str基因座和1个性别决定基因座amelogenin)。相比于illumina公司的forenseqtmdnasignatureprepkit，本发明提供的试剂盒中包含41个新的y-str基因座，能提供更多新的遗传信息。而且本发明提供的复合扩增体系中所有y-str基因座的**大扩增子长度都小于300bp，而forenseqtmdnasignatureprepkit中有约％(7/24)基因座的**大扩增子长度大于300bp，不利于降解检材的分析。本发明提供的试剂盒是本发明的发明人经过大量实验摸索获得的，试剂盒中的引物具有不可替换性；即引物被替换后，部分基因座将会被抑制且抑制效果不可预知。实验证明，采用本发明提供的试剂盒检测标准品2800m中68个基因座的str分型，分型结果准确。本发明具有重要的应用价值。附图说明图1为67个y-str基因座的pcr扩增产物的长度范围分布。具体实施方式以下的实施例便于更好地理解本发明，但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料，如无特殊说明，均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验，均设置三次重复实验，结果取平均值。标准品2800m为promega公司的产品，产品目录号为dd7251。迈杰基于基因组学、蛋白组学、细胞组学及病理组学等综合性转化医学平台，丰富的伴随诊断开发经验。吉林全平台迈杰转化医学NGS平台经验丰富
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上述任一所述复合扩增体系还可包括进行pcr扩增反应所需的试剂。所述“进行pcr扩增反应所需的试剂”不包括pcr扩增反应所需的引物。上述任一所述复合扩增体系可为20μl，由10μl2×mastermix、上述任一所述引物组合和模板组成。2×mastermix具体可为德国qiagen公司的产品。所述模板具体可为浓度为1ng/μl的标准品2800m的水溶液或样品的基因组dna。所述样品可为人口腔拭子。所述标准品2800m具体可为promega公司的产品，产品目录号为dd7251。含有上述任一所述引物组合的试剂盒也属于本发明的保护范围；所述试剂盒的用途可为(h1)-(h5)中的至少一种：(h1)str分型；(h2)y-str分型；(h3)个体识别；(h4)亲权鉴定；(h5)种族推断。本发明还保护上述任一所述复合扩增体系或上述任一所述试剂盒的制备方法；该制备方法包括将上述任一所述引物组合中的各条引物单独包装的步骤。本发明还保护上述任一所述引物组合或上述任一所述复合扩增体系在制备试剂盒中的应用；所述试剂盒的用途可为(h1)-(h5)中的至少一种：。 吉林全平台迈杰转化医学NGS平台经验丰富
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